《食品生產(chǎn)許可證》屬于《工業(yè)產(chǎn)品生產(chǎn)許可證》范疇，但其申請、審查及發(fā)放程序與《工業(yè)產(chǎn)品生產(chǎn)許可證》略有不同。主要有以下3個方面：
    （1）受理申請的機構不同。根據(jù)國家質檢總局的有關規(guī)定，受理《食品生產(chǎn)許可證》申請的是省、市（地）級質量技術監(jiān)督部門。特殊情況下，國家質檢總局也可直接受理企業(yè)申請。而《工業(yè)產(chǎn)品生產(chǎn)許可證》均由省級質量技術監(jiān)督部門負責受理。
    （2）負責組織審查組的單位不同。根據(jù)國家質檢總局的有關規(guī)定，負責組織對申請《食品生產(chǎn)許可證》的企業(yè)進行書面材料審查和現(xiàn)場審查的審查組，是由省市（地）級質量技術監(jiān)督部門組織的。而負責組織對申請《工業(yè)產(chǎn)品生產(chǎn)許可證》的企業(yè)進行書面材料審查的是省級質量技術監(jiān)督部門組織，負責現(xiàn)場審查的機構是省級質量技術監(jiān)督部門或者相應產(chǎn)品的審查部組織的審查組，具體審查部門在產(chǎn)品發(fā)證實施細則中規(guī)定。
    （3）審查內容不同。工業(yè)產(chǎn)品生產(chǎn)許可證生產(chǎn)條件的審查是質量體系審查；食品生產(chǎn)許可證的企業(yè)條件審查為10個生產(chǎn)必備條件的審查。